真菌用什么药杀最彻底，主要看人体感染真菌以后，属于哪一类真菌，感染部位在哪里。如果是皮肤癣菌导致皮肤表层的感染，或者浅部真菌病感染，可以使用外用的抗真菌药膏，大多可以使用硝酸咪康唑乳膏，或者特比萘芬乳膏、复方酮康唑乳膏等等，可以足够的杀死真菌。如果是脚癣出现的浅部真菌病感染，也可以使用抗真菌的药膏外涂。如果是深部真菌病感染，一般需要口服抗真菌药物，通常可以口服伊曲康唑或者特比萘芬。有的真菌病需要特殊的药物治疗，比如孢子丝菌病，需要口服碘化钾治疗，这样治疗最彻底。如果为真菌性脑炎脑膜炎，患者可表现为发热、头痛、恶心呕吐，意识障碍，脑膜刺激征。治疗上需要静脉点滴氟康唑、或伊曲康唑等抗真菌药物治疗。