激光去除扁平疣的效果比较确切。用激光来治疗扁平疣，主要是使用超脉冲二氧化碳激光治疗。超脉冲二氧化碳激光对光束的控制力比较强，作用更为集中，治疗所需要的时间缩短，能够使扁平疣的组织细胞很快坏死、脱落，治愈扁平疣。而且使用这种激光来治疗扁平疣，基本上没有明显的创伤，患者感觉不到痛苦，治疗结束后恢复比较快。不过，任何一种医学治疗方法所产生的治疗效果，在不同的个体之间都是有差异的，并不能确保所有的扁平疣患者用激光治疗后都有满意的效果。