胃肠镜检查主要就诊于消化内科。胃镜检查用于诊断或排除上消化道炎症、溃疡、肿瘤、息肉、憩室、食管胃底静脉曲张、消化道狭窄、畸形或异物等。临床上对胸骨后疼痛，烧灼感，咽下困难，中上腹胀痛，呕吐和上消化道出血的定性定位，上消化道病变的术后随访都应行胃镜检查。结肠镜检查用于诊断结直肠炎症，恶性肿瘤，息肉，憩室等疾病，其适应症为腹痛，腹泻，便秘，便血等可疑结直肠疾病；钡剂灌肠发现可疑病变不能定性；回盲部病变须回肠末端活检等。胃镜检查术前准备需空腹6到8小时以上，估计有胃排空延缓者需禁食更长时间，必要时胃肠外营养支持。结肠镜术前需禁食及肠道准备，肠道准备是肠镜检查成功的关键，合格的肠道准备能减少肠镜操作的难度，并大大提高疾病的检出率。