上大便的时候肛门疼痛有可能是痔疮导致的，也有可能是肛裂导致的。要想明确诊断的话，最好的办法是到医院就诊，让医生实际检查一下就知道了。如果确定是痔疮或肛裂导致的疼痛，一般可以先采用保守治疗的办法，比如温水坐浴，每天1到2次，每次5到10分钟，这样能够保持肛周清洁，促进痔疮的静脉回流，起到消肿止痛缓解症状的作用。在药物方面可以口服痔疮药物，也可以肛门使用痔疮膏，痔疮栓等药物来进行对症治疗。在饮食上要注意避免吃辛辣刺激性的食物，避免喝酒要多喝水，多吃蔬菜水果，保持大便通畅避免大便干结。通过以上的办法，多数的痔疮能够好转。