小便时尿道口疼痛，建议到医院进行检查以后，确定原因，来选择合适的药物。一、首先进行体格检查，了解尿道口无红肿，局部有无溃烂等。如存在局部的溃烂、糜烂或红肿等，建议使用高锰酸钾溶液局部清洗。清洗完毕后，在红肿部位外涂百多邦软膏少许，每日3次，或外涂红霉素软膏少许，每日3次，观察疼痛改善的情况。二、如果体格检查尿道口无红肿、糜烂等反应，需要进行尿液常规检查。如尿常规中有较多的白细胞，或细菌数明显升高，建议口服盐酸左氧氟沙星胶囊，1粒，每日3次，连续口服3-5天，观察尿道口疼痛症状是否缓解。