尿路感染是由于某些因素导致致病菌通过上行感染，血行感染，直接感染，甚至淋巴道感染途径侵袭人体并突破机体防御后而引发的机体发病。基本病因是细菌感染，尿路感染95%上是由于单一细菌感染所引起，其中以大肠埃希氏菌最为常见。其次为克雷伯杆菌，变形杆菌，柠檬酸杆菌等，其他的致病菌还有结核分枝杆菌，衣原体，支原体，真菌，滴虫，病毒等。诱发因素主要是由于泌尿生殖系统在解剖生理方面特点，致使病菌在正常情况下，不能停留繁殖，故不容易引起感染。一旦泌尿生殖系统发生病理改变，防御感染功能遭到破坏，致病菌趁虚而入，从而诱发感染。有结构性尿路梗阻，比如结石、前列腺增生、狭窄、肿瘤、习惯性憋尿等。还有功能性尿路梗阻，如膀胱输尿管反流、神经源性膀胱、妊娠等。还有机体免疫力低下，长期使用免疫抑制剂、糖尿病、艾滋病或者严重慢性病，长期卧床等。还有泌尿系结构异常，如肾发育不良、肾盂以及输尿管畸形、移植肾、多囊肾等。还有女性生理结构特点，尿道比较短、比较宽、比较直，紧离阴道口，肛门较近，还有男性包茎包皮过长。还有些性活动，频繁的性活动导致尿道口周围细菌挤压进入膀胱引起尿路感染。还有一些医源性因素，包括留置导尿管、膀胱镜、输尿管镜检查等。还有些遗传因素也会引起尿路感染。