精子的畸形率高，目前认为常见的几个原因：1、附属性腺的感染，比如常见的精囊腺炎，前列腺炎等，存在着一定的关系。2、精索静脉曲张。3、医源性的因素，比如用药，放疗，手术等引起。4、全身性的因素，包括消耗性的疾病，比如常见的糖尿病，甲状腺功能亢进等等。5、先天性的异常，比如隐睾。另外，获得性的睾丸损伤，比如腮腺炎引起的睾丸炎等等。6、内分泌的原因，常见的比如睾酮的异常。7、另外，精子畸形率偏高的很重要原因是包括生活或者工作的环境因素。比如，长期接触到受污染的饮食，或者空气，水污染，生活习惯的影响，比如抽烟喝酒穿紧身的裤子，洗桑拿浴。这些都会对精子的形态造成一定的影响。