狼疮性肾炎的病因不明，目前研究发现遗传，感染，药物，物理环境，内分泌等因素均与本病发病密切相关。遗传因素，本病近亲的病人，近亲发病率高达5%到12%，同卵孪生发病占69%，而异卵孪生发病仅占3%。黑人与亚裔人群发病率明显的增高，这些均显示本地受遗传因素的影响。遗传因素只是一种易感倾向，环境因素在本病的促发中，起重要作用。紫外线感染，药物等因素也参与了本病的发病，还有巯基等结构的药物可以细胞核组蛋白结合，与淋巴细胞作用导致自身免疫异常，日光照射可加入本病见于40%的病人，紫外线可使DNA转化为胸腺嘧啶二聚体，变性后抗原性增强，诱发自身抗体，形成免疫复合物。育龄期的女性发病率高，提示有内分泌因素影响的作用。