肾囊肿很可能会影响肾功能。对于体积比较小的肾囊肿，一般不会引起明显的临床症状，对肾功能没有影响，不用特殊的处理，定期复查双肾ct监测囊肿的大小就可以。但是对于多发、直径大于5厘米的囊肿，容易压迫正常的肾脏组织，造成肾小球滤过率下降，可能会影响肾功能，严重者会造成肾功能减退。所以如果平时出现腰酸、腰痛、血尿、乏力等表现，一定要及时就医，完善双肾ct等检查明确囊肿的大小，必要的时候行手术治疗。