阵发性睡眠性血红蛋白尿临床上主要表现为慢性血管内溶血，造血功能衰竭以及反复血栓的形成。治疗上主要是控制溶血的发作，会使用糖皮质激素、碳酸氢钠以及免疫抑制剂，也常常会使用雄激素刺激血红细胞生成。长期血红蛋白尿可导致缺铁，在明确缺铁后应从小剂量开始治疗。此外，输血也起到很好的效果。输血除了能够提高血红蛋白，维持组织需氧，尚能抑制红细胞生成。对于难治性的也可以采取联合化疗的方法去进行处理，比如说使用柔红霉素以及阿糖胞苷。