月经期肚子疼，大多是原发性痛经，是功能性的，与正常的排卵有关，没有盆腔疾病，但有部分可能是子宫先天发育异常。还有部分痛经病人可能会随着时间的推移，逐渐查出盆腔疾病，如子宫内膜异位症。大部分痛经可能与月经期子宫异常收缩有关，比如说局部前列腺素白三烯类物质，血管加压素，催产素的增高有关。月经期，前列腺素合成和释放过多，导致子宫收缩过强，局部缺血，引起痛经。血管紧张素和催产素过高，也是引起痛经的另一个原因。