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脑栓塞可能是心房纤颤形成的附壁血栓脱落,造成的脑血管堵塞,或者卵圆孔未闭,肺动静脉畸形导致的栓子脱落。体循环右到左的分流导致的栓塞,可以称之为反常性的栓塞,或者颈动脉,主动脉弓,动脉血管斑块脱落,可以造成栓子阻塞血管。心源性的脑血栓,心肌炎,心内膜炎形成栓子,也可以造成血管的栓塞。免疫系统疾病导致的动脉炎,感染性疾病,比如钩端螺旋体病,结核,病毒可以引起血管炎症,引起脑栓塞。血液系统疾病,红细胞增多症,血小板增多症,也可以形成脑血栓形成。