藿香正气水主要作用是解表化湿，理气和中，主要适用于胃肠型感冒中由于外感风寒，内伤湿滞所引起的恶寒发热，头身困重或疼痛，胸脘满闷，恶心，纳呆，舌淡红苔白腻，脉浮缓的患者，也可以用于湿阻气机所导致的，泄泻暴作，便下清稀，肠鸣，腹痛，脘闷纳呆，伴有恶寒发热，周身酸楚的患者，还可以用于治疗，由于夏季外感暑湿，气机受阻所引起的突然恶寒发热，头昏欲扑，胸脘满闷，恶心呕吐，甚则昏仆倒地，舌苔白腻的患者。此药还可以用于治疗中暑，急性胃肠炎，糖尿病相关，腹泻，湿疹，汗疹等皮肤问题。