龟头上长疱可能的原因：1、单纯疱疹病毒感染后出现，常见于2型单纯疱疹病毒感染后，可出现在龟头上透亮的水疱，疱液内含有疱疹病毒，经性接触可致传播。建议留取疱液作单纯疱疹病毒的PCR检查或者进行血液单纯疱疹病毒检查，予以排除或者确诊。2、白色念珠菌性龟头炎或者滴虫菌性的龟头炎，都可出现龟头上针头样大小的水疱，同时伴有龟头红斑样改变，表面光滑。水疱破裂后可出现局部的糜烂和溃疡，同时伴有较为明显的疼痛。建议如果有不洁的性接触史，并且龟头上出现水疱，要进行排除真菌和滴虫感染的可能。建议进行涂片检查或者显微镜下寻找滴虫等检查，予以排除或者确诊。