阴茎上有疙瘩，可以通过以下方式处理：1.如果明确是阴茎毛囊炎，或皮脂腺发炎引起，每天可用温水清洗保持阴茎的干燥，涂抹红霉素软膏、莫匹罗西软膏，促进炎症消除，一般1个星期就可以好转。2.如果是珍珠疹引起的疙瘩，不会疼痛，也不会瘙痒，对人体不会造成危害，不用特殊处理。3.尖锐湿疣引起的疙瘩，可通过激光、冷冻、手术的方式切除，夫妻之间同时治疗，避免交叉感染。4.包皮过长、包茎引起龟头炎导致的疙瘩，每天可用高锰酸钾清洗，局部涂抹消炎的药膏，控制炎症后，尽快做包皮环切手术。