在肛瘘早期，可以采用保守治疗，比如说可以口服迈之灵，一天三次，每次两片，也可以使用太宁栓或者是肛泰栓肛塞，每天一粒，另外也可以局部涂抹太宁乳膏，每天一次到两次。同时也可以使用中药熏蒸坐浴，比如可以选用花椒、艾叶、蒲公英等，开水熬汤，熏蒸坐浴，每天一到两次，每次十五到二十分钟，同时还要注意避免久坐久站，要养成定期排便的习惯，尽量的避免食用辛辣、生冷、油腻、刺激性的食物，戒烟、戒酒，尽量的少吃海鲜，比如说鱼虾，要注意避免腹泻或者便秘，保守治疗效果不好的话，可以选择手术治疗，比如说肛瘘切开引流术，肛瘘切开挂线引流术。