肛周脓肿的治疗一般分为非手术治疗和手术治疗。非手术治疗包括口服中药，还有中药熏洗治疗。如果在肛周脓肿的早期可用仙方活命饮，起到清热解毒，消肿止痛的作用。还可以应用苦参汤或者止疼如神汤进行肛周熏洗，起到消肿消毒的作用。如果通过非手术治疗，症状逐渐加重，还应当积极的行手术治疗。手术的原则就是尽早的切开引流，引流应当通畅，不留死腔。如果没有找到可靠的内口，可以先切开排脓，待形成肛瘘后再行2次手术。