根据肛周脓肿发生的部位、深浅不同，其临床表现是有所不同的。但大体上看，脓肿位置比较表浅的，以局部肿痛症状为主，全身症状不明显；脓肿位置较深的，以发热等全身症状为主，局部症状不是很明显或比较轻微。浅部的脓肿主要表现为局部红肿，发硬，触痛明显，持续性胀痛，排便及活动后疼痛加重，患者不敢端坐。如果是深部的脓肿，会表现为发热，倦怠，食欲不振或者感觉直肠内灼热感，沉重坠胀感，可引起排便不畅，排尿困难。由于肛周脓肿主要是发生在肛周的间隙，里面主要是由脂肪组织填充，炎症很容易在其中扩散。发病后很快就会出现典型的症状，因此需要及早采用抗生素治疗或及时切开排脓。