肥厚型心肌病的治疗目标为改善症状，减少并发症和预防猝死，治疗方法主要包括药物治疗和手术治疗。对于肥厚性非梗阻型心肌病无特殊治疗，定期复查，观察病情变化即可，对于肥厚性梗阻型心肌病患者应予以规律的药物治疗，必要时考虑手术治疗，可以给予使用减轻左心室流出道梗阻的药物，如β受体阻滞剂，非二氢吡啶类钙通道阻滞剂，有助于肥厚性梗阻型心肌病的治疗，但其治愈的根本途径是需要通过手术治疗，如室间隔切除或酒精室间隔消融术等。