真菌感染有的可引起皮肤黏膜的病变，有的只可引起内脏器官的病变。首先，皮肤癣菌等浅部真菌感染主要是引起皮肤以及黏膜部位的病变。比如感染躯体皮肤，可引起体癣、股癣；感染手足部可以出现手癣、脚癣，主要表现为局部的红斑、鳞屑、水泡、瘙痒等等症状。还可以感染头皮毛发，引起头癣，导致头发的折断和脱发；还可以感染指甲，引起指甲的变形、增厚。有些真菌可以感染黏膜，比如念珠菌病，可以导致口腔里面出现鹅口疮。还有的真菌可以感染深部的组织器官，引起深部包括内脏器官的病变。