在阴茎上有小水泡的原因有很多，有细菌感染、不注意个人卫生，或有手淫的习惯，以及有过不洁净的性接触史等等，而最常见的是生殖器疱疹。生殖器疱疹潜伏期在2～7天，在3～5天后可形成脓疱，破溃后形成糜烂溃疡，结痂伴有疼痛。而治疗方面主要是采用抗病毒治疗。治疗的目的主要是缓解症状，减轻疼痛，一般主要是保持局部的清洁干燥，可每天用等渗生理盐水清洗，疼痛者可口服止痛药；并发细菌感染者可外用抗生素药膏。推荐抗病毒治疗方案包括阿昔洛韦口服，每天五次。如果效果不佳，建议到当地的性病科，或者是皮肤科，或者是泌尿外科就诊。