引起睾丸附睾炎的病原体比较多，如果是细菌感染引起的睾丸附睾炎，可以选择抗生素治疗，可以选用喹诺酮类抗生素和头孢类抗生素治疗，比如莫西沙星、左氧氟沙星、头孢地尼、头孢唑肟等抗生素治疗，首选口服治疗，如果病情严重的可以使用静脉输液治疗，治疗周期是十天到14天。如果是病毒感染引起的，如腮腺病毒引起的睾丸附睾炎，可以用抗病毒的药物进行治疗。还有特异性的病原体，如结核杆菌引起的睾丸附睾炎，这种情况要选择抗结核药物治疗，如利福平、异烟肼等药物。