阴茎上长疙瘩的原因有好几种。可能是阴茎发炎，主要就是不注意卫生，可能出现阴茎包皮龟头炎。也可能是阴茎上方有疱疹，这种情况会有明显的水疱样改变，有发痒，有疼痛，可能与不洁性交有关。男性的生殖器处于一种比较潮湿的部位，容易长湿疹，也会出现长疙瘩。也可能是毛囊炎，因为在男性的生殖器遍布大量的毛囊，不注意卫生，出现堵塞，就可能出现毛囊肿大阴茎出现小疙瘩。一定要及时检查及时进行治疗，不能大意。如果持续加重，就要到医院做进一步的检查确诊。