一旦明确肛瘘，应当积极的行手术治疗，还可以通过药物治疗，作为手术治疗的辅助治疗手段，可以口服一些中药比如托里消毒饮，起到托里透毒的作用。还可以口服青蒿鳖甲汤，起到养阴清热的作用。还可以应用一些中成药物比如补中益气丸，起到增强患者体质的作用。如果肛瘘合并感染，还可以应用针对革兰阴性菌的抗生素或广谱抗生素，还可以加用抗厌氧菌的药物，比如甲硝唑、替硝唑等进行治疗。根据肛瘘瘘管位置的高低，选择合适的手术方式，可以行肛瘘切除术，也可以行肛瘘切开挂线治疗，术后注意饮食调理，积极的给予药物治疗。以上方案仅供参考，具体药品使用请结合自身情况在专业医生指导下用药。