怀孕三个月，胎儿停止发育，常见的原因有以下几种。第一，70%是由于胚胎自身染色体有异常，这就包括遗传自父方或母方的染色体有缺陷，以及在受精卵形成之后，受到外界高热、病毒、细菌、化学药物、精神、心理因素等影响出现了染色体突变。第二 ，孕妇本人有严重的自身基础性疾病，比如严重的贫血、甲状腺功能异常、自身免疫性疾病。第三，有子宫内膜病变或者子宫发育畸形 ，比如子宫内膜息肉、子宫粘膜下肌瘤、或者双子宫、双角子宫等等。