肛门疼痛的治疗，主要有对症治疗和针对病因治疗。如果疼痛比较剧烈，可以考虑口服止痛药来减轻疼痛。市面上常用的有艾瑞昔布、双氯芬酸钠等止痛药物。具体的治疗要根据病因来确定，比如肛裂，在基本的这种治疗情况下，还可以使用直肠粘膜保护剂，外用坐浴的方法来促进肛裂愈合，外涂药膏的方法来减轻裂口的疼痛，促进裂口的愈合。对于痔疮的疼痛，一般是由于炎性外痔或者是外痔水肿造成的。可以口服血管活性药物来减轻痔的充血。如果是血栓外痔可以进行手术治疗。所以出现肛门疼痛，具体用药最好是在当地医院的医生指导下使用，不可自行盲目使用。