阴茎尿道出现疼痛的原因可能是尿道炎。如果患者出现了疼痛的症状，首先需要去做尿常规的检查，看尿中的白细胞水平是否升高。如果升高说明存在炎症，可以取尿道分泌物做病原体的检测，区分是淋球菌性的尿道炎还是非淋球菌性的尿道炎。如果是淋球菌性的尿道炎可以使用头孢进行抗感染治疗。如果是非淋球菌性的尿道炎，可以使用抗生素进行治疗。但也要注意是否有尿道结石梗阻的现象，可以通过膀胱镜来随时治疗。