小拇指关节疼的原因主要有外伤，腱鞘炎、骨关节炎等因素。如果是类风湿关节炎，小拇指疼痛可能同时伴有同侧和对侧的食指、中指、环指的掌指关节、指间关节疼痛，同时伴有晨僵。单独的小拇指疼痛，包括远端指间疼痛和近节之间关节疼痛，还有掌指关节疼痛，具体要看具体的原因是什么？如果是疼痛伴有囊肿和弹响，有可能是腱鞘囊肿或者狭窄性腱鞘炎。如果是狭窄性腱鞘炎，需要限制活动、外用药、封闭等治疗。