阴茎短小可以选择药物治疗，也可以选择手术治疗，具体治疗方法需要根据年龄以及病情的轻重程度决定。如果阴茎短小不是特别严重，也处于青春期，还在逐渐发育，可以选择药物治疗，比如说补充雄性激素，也可以遵医嘱口服补肾壮阳类的药物调理身体，如果已经成年阴茎基本上发育完善，不会自己在生长，可以选择手术治疗，比如说阴茎延长的手术，对医生的要求比较严格，所以应该选择正规医院，选择经验丰富的医生操作。手术之后做好正确的后期护理，注意伤口部位的干爽和清洁，不要太早沾水。