肾盂肾炎的治疗，最好是做尿液的细菌学检查及药敏试验。如果没有条件做的话，那么在治疗方面，要选择针对革兰石阴性杆菌的药物。因为绝大部分的肾盂肾炎的致病菌是由于大肠杆菌所引起的。在治疗方面可以选用喹诺酮类的药物，如诺氟沙星，或者是氧氟沙星或者是左氧氟沙星，半合成的青霉素类，可以选用安边西林，或者是阿莫西林，或者是匹氨西林，也可以使用头孢类的药物。头孢拉定或者是头孢呋辛酯等都可以选用，一般治疗至少14天，不可以过早的停药。治疗14天时进行尿液的细菌学检查。如果尿菌仍然为阳性，则要选用敏感的抗生素继续治疗6周，这个一定要注意。