治疗萎缩性胃炎的药物包括以下几个方面，1，弱酸治疗，2，根除幽门螺杆菌治疗，3，抑制胆汁反流和改善胃动力治疗，4增加黏膜营养治疗，5，五肽胃泌素治疗。其中弱酸治疗可选用多酶片或者胰酶片，以及胃蛋白酶合剂等等，根除幽门螺杆菌治疗，可选择质子泵抑制剂与阿莫西林克拉霉素，呋喃唑酮甲硝唑等等抗生素中的两种联合枸橼酸铋钾片进行四联疗法，根除幽门螺杆菌。抑制胆汁反流和改善胃动力，可以使用西沙必利，莫沙必利以及熊去氧胆酸等等药物，增加黏膜营养，可以使用生胃酮，前列腺素e等等药物治疗。