小拇指关节疼痛的原因如下：一，板机指，多由于手指长期从事一种动作过度疲劳，导致手掌指关节处肌腱劳损，形成结节，当关节活动时会产生弹响或疼痛。二，有外伤史，表现为关节疼痛、肿胀、活动受限，需考虑手指骨折或脱位，拍手指X光片可以确诊。三，指间关节囊损伤，多有劳损或外伤史，表现为指间关节囊疼痛肿大，但关节活动度基本正常。四，需排除肿瘤的可能，比如骨瘤、骨囊肿等异常情况，拍手指X光片可以确诊。五，需排除痛风性关节炎，类风湿性关节炎等等。