首先要明确疾病的类型再选择合适的药物。脚上长水疱，在临床上有几种疾病：1、足癣，临床上有水疱型的足癣，还有浸渍型和鳞屑角化过度型的。需要先到医院找医生面诊，做真菌的涂片和培养检查。如果明确是真菌感染，可以选择1比5千稀释的高锰酸钾溶液进行泡脚，等水疱收干以后，再来选择抗真菌的药物，如特比萘芬喷剂、布替萘芬喷剂等。2、汗疱疹，一般是对称分布在脚的两边，主要是在脚趾的末端，还有脚底这些区域出现，伴有剧烈的瘙痒，临床上认为它是属于湿疹的一种类型。也可以用硼酸洗液或者用肤疾洗剂进行局部的泡脚，等水疱干了以后再用糖皮质激素软膏，配合一些保湿润肤产品进行对症处理。