小便时候会痛常见原因有：一、泌尿系感染：可有尿频、尿急、尿痛、血尿等，尿常规可见白细胞、有时有红细胞。治疗以抗感染为主。二、慢性前列腺炎：多见于中青年男性，可有尿频、尿急、尿痛、会阴部不适等，尿常规一般无异常。治疗以α受体阻滞剂+中成药为主。三、慢性膀胱炎：主要是腺性膀胱炎和间质性膀胱炎。多见于中青年女性，可有尿频、尿急、尿痛、下腹部隐痛不适等。尿常规可见白细胞、红细胞，膀胱镜检可明确诊断。临床治疗效果通常不理想。