不洁的性接触感染人乳头瘤状病毒龟头上有小疙瘩需要到医院进行检查来明确可能的原因，最常见的原因：1，尖锐湿疣，它是一种性传播的疾病，是由于不洁的性接触感染人乳头瘤状病毒所致，这时可以造成有龟头上菜花样或者乳头样的疙瘩。需要到医院进行醋酸白试验检查或者进行局部的切除，病理化验检查来进一步的确诊。2，龟头炎可以造成有龟头表面红颜色的突起，伴有局部的疼痛或者伴有局部的瘙痒等，可能由于细菌感染所致，也可能是由于真菌、滴虫等感染所致，还可能是由于局部包皮垢较多或者长期污垢较多慢性刺激所致。需要进一步的进行局部的涂片检查来明确病原菌以后，使用敏感的抗生素进行治疗。