结膜炎的治疗原则是针对病因治疗，局部用药为主，必要时全身用药，急性期禁忌包扎。细菌性结膜炎主要选用左氧氟沙星眼药水，每1-2个小时一次滴眼，病情好转后减少滴眼次数。病毒性结膜炎选用阿昔洛韦滴眼液或者更昔洛韦眼用凝胶，晚上涂氧氟沙星眼膏。当结膜囊分泌物比较多时，可以用生理盐水每天冲洗结膜囊1-2次。对于严重的结膜炎，比如淋球菌性结膜炎和衣原体性结膜炎，除了局部用药以外，还需要全身服用相应的抗生素。