阴茎小，首先应考虑可能是生长激素分泌不足所引起。阴茎的发育主要是生长激素与雄激素共同作用，当激素分泌不足时，就会对阴茎的发育造成影响，致使阴茎短小。也可能是睾酮存在问题，如果睾酮分泌不足或者是由于受到某些因素的影响，导致睾酮的作用下降。比如性腺轴启动较慢或者是功能不好，都可能会造成阴茎短小。此外，还可能为隐匿性阴茎所致。实际上这类男性的阴茎体积和同龄男性并没有明显的差别，仅是从外观上看起来很小。主要是因为阴茎周围的脂肪较厚，致使阴茎被脂肪包裹，所以从表面看显得阴茎较小。