引起小儿慢性胃肠炎的原因，包括：感染、饮食不当、过敏等等，针对不同的病因，所使用的药物治疗的方式也会不一样。如果是感染引起的慢性胃肠炎，需要给他积极的抗感染治疗；如果是喂养不当引起的急性胃肠炎，则需要给他调整饮食；如果是过敏因素引起胃肠炎，则需要查明过敏原因，比如蛋白质过敏，则需要给他使用深度水解奶粉。不管哪种原因引起的急性胃肠炎，都需要稳定宝宝胃肠道的菌群，保护胃肠道的功能，可以给宝宝吃益生菌类的药物和保护胃肠道的药物，包括：妈咪爱、蜡样芽孢杆菌、蒙脱石散、蒙脱石混悬液等等，同时可以让宝宝服用锌剂，通过补锌促进胃肠道粘膜的修复。以上方案仅供参考，具体使用情况请按药品说明或到正规医院按医嘱用药。