除去水箱的水锈水垢的方法如下：
1、人工清洗，首先把汽车水箱拆卸下来，用刮刀、铁锹等清除水垢，这样虽然可以除垢，但效率低，劳动强度大，不易清除干净，而且容易对水箱造成二次损伤；
2、使用除垢剂，需拆卸水箱，去除不彻底的话，气味大，腐蚀性强，容易引起水箱老化，缩短其使用寿命；
3、使用专业汽车水箱除垢剂，直接将专用的水垢清洗剂倒入汽车水循环系统中，让其浸泡、怠速循环或行驶20-30分钟后，将水箱和系统内的除垢剂排放，加水反复冲洗清洗可有效去除汽车水箱中的的垢、绣、泥等多种有害物质。