头孢曲松钠的副作用主要表现在过敏反应、胃肠道反应、血液系统反应以及肝、肾功能损害。头孢曲松钠是头孢类抗菌药物，主要用于治疗由敏感菌引起的各种感染。头孢曲松钠可能会造成过敏反应，表现为皮疹、瘙痒，严重的甚至可能会发生过敏性休克，导致死亡，因此建议使用头孢曲松钠前最好进行皮试。40%-50%的头孢曲松钠是通过胆道排泄，所以，如果以前有过胆红素升高或者其他胆囊疾病的患者，应该尽量避免使用头孢曲松钠，以免发生胆道或者肝脏损害。头孢曲松钠可以造成血小板增多，严重的可以发生溶血性贫血。50%-60%的头孢曲松钠是从尿液中排出，所以肾功能不佳的患者在使用头孢曲松钠时应该加强监测。