阴茎上面有小泡泡则建议到医院进行检查，明确病因以后再决定如何消除处理。第一、阴茎的疱疹病毒感染这时可以出现小疱伴有局部的疼痛、渗出等改变。大多是通过性接触传播需要进行疱疹病毒的检测。如确诊存在病毒感染则需要进行抗病毒的治疗。可以静脉输注更昔洛韦注射液0.25克，静脉滴注，每日2次，连续使用一周。小泡外涂更昔洛韦软膏少许，每日3次，连续外涂一周。观察小泡是否消除。第二、如果出现有包皮炎、龟头炎等则可出现包皮、龟头等部位的小疱。同时伴有龟头红斑或者包皮的红斑等需要进行分泌物的涂片检查。如确诊细菌感染或真菌感染则根据检查结果来选择百多邦软膏，局部外涂，每日三次。如是真菌感染则可选择米康唑软膏，局部外涂，每日3次，连续使用一周。