六毫米以下的结石比较光滑没有坎盾和梗阻，这类结石适合采用药物治疗，它在局部停留最好不多于两周，当体外冲击波碎石术后残留结石可以采用药物排石。常用的药物有阿尔法受体阻滞剂，代表药物就是盐酸坦索罗辛，它的机理就是松弛输尿管平滑肌以利于结石排出，还有碱性聚氨酸盐它对尿酸和胱氨酸结石治疗有效。钙离子拮抗剂代表药物有硝苯地平，它的机理也是松弛输尿管平滑肌利于结石排出，另外还有一些中药以及中成药排石冲剂和肾石通等