结石引起的原因有很多，主要与年龄，性别，种族，遗传，环境因素，饮食习惯和职业有很大的影响。身体的代谢异常，尿路的梗阻、感染、异物和药物的使用，是结石形成最常见的原因。重视和解决这些问题，能够减少结石的形成和复发。代谢异常，主要就是形成尿结石的物质排出增多，比如尿中钙、草酸、尿酸、胱氨酸排出量增加，尿液PH值改变，也会形成结石增加。尿中抑制晶体形成和聚集的物质减少，最常见的就是枸橼酸减少，焦磷酸盐减少等。尿量减少，尿也中有机盐、无机盐的浓度增高，也会形成。局部因素，主要就是尿路存在梗阻、感染，这些因素相互因果。药物因素也很重要，包括乙酰唑胺、维生素D、氨苯喋啶的使用。