如果舌头反复溃疡，在不同的部位，说明得了复发性阿弗他溃疡，目前病因不清，存在着个体差异，国内外学者认为和一些因素有关，常见的因素有免疫因素、遗传因素、全身系统性疾病、细菌感染和环境因素。包括心理环境、生活工作环境和社会环境等，也和食物中缺乏锌、铁、硒等元素或维生素B1、维生素B2、维生素B6、维生素B12及叶酸等摄入不足可能有关。如果是在某一固定部位反复发生舌头溃疡，就有可能是创伤性的溃疡。有可能局部有一些能够导致口腔黏膜创伤的刺激因素，反复的刺激舌黏膜，引起溃疡，例如局部有残根、残冠、不良修复体或者有尖锐的牙尖或者边缘嵴，或者有大块粗糙的牙石或者异位阻生的智齿，都可以造成舌头反复溃疡。