孕妇在怀孕期间得了霉菌性阴道炎，可以使用以下几种药物来进行治疗：1、可以使用碳酸氢钠溶液冲洗阴道，霉菌性阴道炎是由于念珠菌感染引起的，念珠菌在酸性的环境当中容易繁殖和生存，在碱性的环境当中不容易生存；2、可以使用制霉菌素栓阴道上药治疗，制霉菌素栓可以起到抗真菌的作用，对于霉菌性阴道炎所引起的白带增多、外阴瘙痒等症状，具有很好的治疗作用；3、可以使用苦参凝胶阴道上药治疗，苦参凝胶具有清热利湿、杀虫止痒的作用，可以缓解霉菌性阴道炎所引起的不适症状。由于女性在怀孕期间比较特殊，建议患者一定要在医生的指导下使用以上药物，以免出现不良反应。