右侧睾丸肿大疼痛最常见的原因包括右侧睾丸炎，附睾炎，睾丸扭转，外伤，应用的药物需要根据病因来选择。如果是右侧睾丸炎，附睾炎通过化验血常规、彩超检查，确诊是细菌性感染，需要头孢或者喹诺酮类抗生素对症治疗，病毒性感染需要抗病毒药物治疗，比如利巴韦林、阿西洛韦等，如果睾丸扭转导致的疼痛肿大程度较轻的，需要通过手法复位或者自己复位，较重的需要手术复位治疗。如果有明显的外伤，轻度的可以通过口服活血化瘀药物，预防感染，重度的需要通过手术治疗。