临床上根据患者尖锐湿疣的大小以及患者耐药的程度，治疗的方法是不同的，一般有微波治疗，它的原理是利用微波的高频振动使疣体内部水分蒸发、坏死、脱落，微波治疗的特点是疣体破坏彻底不易复发，但创面恢复比较慢，容易继发感染。一般是针对比较大的疣体的治疗。冷冻疗法是皮肤病常用的治疗方法，以液氮或二氧化碳干冰冷冻皮肤病损，使皮肤损害局部水肿坏死，以达到治疗的目的，尖锐湿疣是由于尖锐湿疣病毒的感染引起的，它拥有大量的血管，增殖迅速，用冷冻的方法可以使尖锐湿疣内结冰，形成组织局部的高度水肿，从而破坏疣体。激光治疗，皮肤科常用治疗尖锐湿疣的方法之一，它的特点是见效快，在治疗的当时疣体就可以脱落，光动力疗法治疗尖锐湿疣对于其他的物理治疗方法而言，创面比较小，局部损害少。