妥布霉素滴眼液等三岁左右的宝宝在患结膜炎之后常用的滴眼液为抗生素类的滴眼液，比较安全的有妥布霉素滴眼液，左氧氟沙星滴眼液。应用这两种滴眼液之后，大部分的细菌感染导致的结膜炎都能够治愈。同时为了减轻患儿的症状，加速病程的进展，还可以进行结膜囊的清洗，将结膜囊内分泌物和细菌清洗干净，这样有利于抗生素滴眼液的吸收。同时在应用滴眼液时，也防止滴眼液瓶口沾到结膜囊内的细菌和分泌物之后造成滴眼液的污染。