晨起手指关节僵硬伴有疼痛，主要还是看临床的表现，以及临床的诊断。根据不同的疾病来采取不同药物治疗，早晨起来手指关节僵硬伴有疼痛，临床上常见的疾病包括以下几种：一、退行性的骨关节炎，指的原发性骨关节炎，多跟老年人关节软骨的退变增生、手指的发凉，或者是寒冷、潮湿的环境下诱发的骨关节炎比较多见。多以无菌性关节炎为主，急性期可以伴有双侧手指指尖关节的红、肿、热、痛，在经过休息、热敷、理疗或者外用消炎、止痛类药物，如扶他林或者膏药，大多可以获得缓解。如果症状比较重，也可以口服非甾体类的抗炎镇痛药，以及硫酸基葡萄糖类的药物。二、好发于青年女性，晨僵时间较长，同时多个关节同时起病，伴有明显的畸形，这时就要考虑是否与类风湿性关节炎或者其他自身免疫性的骨关节炎有关系。要诊断这种疾病，需要到医院的风湿免疫科进行排查，如果排查完确实是类风湿性关节炎，用的药物主要如下：1、非甾体类抗炎镇痛药，比如洛索洛芬、双氯芬酸、布洛芬等。这类药物主要是改善关节的红、肿、热、痛，改善功能。2、抗风湿药物的治疗，一般包括甲氨蝶呤、来氟米特、柳氮磺吡啶等等。但这类药物比较特殊，在使用过程中应该严格按照风湿免疫科和骨科大夫指导下进行，因为这种药物过量容易引起肝肾功能的损害。3、生物制剂类的药物，这类药物比较贵，更应在专业医师指导下进行服用。