亚急性甲状腺炎的患者一般会用到的药物，例如有左甲状腺素钠片，非甾体类抗炎药，β受体阻滞剂，糖皮质激素。亚急性甲状腺炎患者出现了永久性甲状腺功能减退的时候，或者是患者处于了甲减期，但是甲状腺功能减退比较严重的时候，常通过补充甲状腺激素类药物进行治疗。患者一般疼痛比较明显的时候首选非甾体类抗炎药进行治疗。随着病情进一步的加重，有可能会进一步选取糖皮质激素进行治疗。而β受体阻滞剂主要控制患者的心率。